Le feuillage de celui d'Europe est vert-jaunâtre, celui du Japon est vert bleuté.
Les écailles du cône de celui d'Europe sont appliquées, celles de celui du Japon ont l'extrémité recourbée.
L'écorce du jeune rameau du mélèze d'Europe est jaune pâle, celle du mélèze du Japon est jaune orangée.
L'habitat : En plaine ou en zone de collines sous un climat océanique (Bretagne, Limousin) on utilise le mélèze du Japon. Le mélèze d'Europe ne pousse qu'en haute montagne et n'est pas adapté aux conditions de plaine, sauf quelques provenances d'Europe centrale (Sudètes) mais on ne les trouve pas fréquemment.